Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NuggcD3YWJ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NuggcD3YWJ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NuggcD3YWJ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NuggcD3YWJ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NuggcD3YWJ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NuggcD3YWJ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NuggcD3YWJ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NuggcD3YWJ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NuggcD3YWJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms