Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2d4D3YUH6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d4D3YUH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d4D3YUH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d4D3YUH6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d4D3YUH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms