Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Otud7bB2RUR8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Otud7bB2RUR8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Otud7bB2RUR8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Otud7bB2RUR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Otud7bB2RUR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Otud7bB2RUR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Otud7bB2RUR8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Otud7bB2RUR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otud7bB2RUR8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Otud7bB2RUR8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Otud7bB2RUR8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Otud7bB2RUR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Otud7bB2RUR8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Otud7bB2RUR8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Otud7bB2RUR8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Otud7bB2RUR8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Otud7bB2RUR8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Otud7bB2RUR8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Otud7bB2RUR8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Otud7bB2RUR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Otud7bB2RUR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms