Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
AU015836B2RUM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
AU015836B2RUM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
AU015836B2RUM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
AU015836B2RUM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
AU015836B2RUM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
AU015836B2RUM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
AU015836B2RUM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
AU015836B2RUM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
AU015836B2RUM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
AU015836B2RUM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
AU015836B2RUM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
AU015836B2RUM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
AU015836B2RUM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
AU015836B2RUM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
AU015836B2RUM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,52■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
AU015836B2RUM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
AU015836B2RUM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
AU015836B2RUM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
AU015836B2RUM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
AU015836B2RUM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
AU015836B2RUM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms