Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apba1B2RUJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba1B2RUJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apba1B2RUJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba1B2RUJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apba1B2RUJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba1B2RUJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apba1B2RUJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apba1B2RUJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apba1B2RUJ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms