Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm2012B1B0R1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm2012B1B0R1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm2012B1B0R1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm2012B1B0R1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gm2012B1B0R1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm2012B1B0R1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm2012B1B0R1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm2012B1B0R1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm2012B1B0R1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm2012B1B0R1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm2012B1B0R1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm2012B1B0R1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms