Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CK137956B1AYM9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CK137956B1AYM9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CK137956B1AYM9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CK137956B1AYM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CK137956B1AYM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CK137956B1AYM9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CK137956B1AYM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CK137956B1AYM9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CK137956B1AYM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CK137956B1AYM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms