Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
NhsB1AV60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
NhsB1AV60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
NhsB1AV60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,96■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,95■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,99
NhsB1AV60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
NhsB1AV60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
NhsB1AV60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,87■■■■□ 3,97
NhsB1AV60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,83■■■■□ 3,97
NhsB1AV60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39,8■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,79■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,79■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39,78■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
NhsB1AV60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
NhsB1AV60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39,71■■■■□ 3,95
NhsB1AV60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
NhsB1AV60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
NhsB1AV60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39,69■■■■□ 3,94
NhsB1AV60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
NhsB1AV60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
NhsB1AV60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
NhsB1AV60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,65■■■■□ 3,94
NhsB1AV60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
NhsB1AV60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,58■■■■□ 3,93
NhsB1AV60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,54■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
NhsB1AV60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
NhsB1AV60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39,44■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39,43■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39,41■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39,39■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
NhsB1AV60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39,38■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39,37■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39,36■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,33■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
NhsB1AV60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39,31■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39,28■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39,26■■■■□ 3,88
NhsB1AV60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39,2■■■■□ 3,87
NhsB1AV60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39,19■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,18■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39,14■■■■□ 3,86
NhsB1AV60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39,13■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39,12■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39,11■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,11■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,09■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,85
NhsB1AV60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,84
NhsB1AV60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,84
NhsB1AV60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39,06■■■■□ 3,84
NhsB1AV60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
NhsB1AV60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms