Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Spocd1B1ASB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Spocd1B1ASB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Spocd1B1ASB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Spocd1B1ASB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Spocd1B1ASB6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Spocd1B1ASB6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Spocd1B1ASB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Spocd1B1ASB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Spocd1B1ASB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Spocd1B1ASB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66,2 ms