Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms