Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt3B0QZW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt3B0QZW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt3B0QZW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt3B0QZW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt3B0QZW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt3B0QZW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt3B0QZW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt3B0QZW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt3B0QZW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt3B0QZW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt3B0QZW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt3B0QZW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt3B0QZW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt3B0QZW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt3B0QZW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms