Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint2A7XUX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint2A7XUX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint2A7XUX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint2A7XUX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skint2A7XUX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skint2A7XUX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skint2A7XUX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skint2A7XUX6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms