Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4A4UUI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp4A4UUI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4A4UUI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp4A4UUI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gbp4A4UUI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp4A4UUI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp4A4UUI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp4A4UUI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp4A4UUI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp4A4UUI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms