Protein–RNA interactions for Protein: A2BHN9

4931422A03Rik, RIKEN cDNA 4931422A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931422A03RikA2BHN9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931422A03RikA2BHN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931422A03RikA2BHN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931422A03RikA2BHN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4931422A03RikA2BHN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4931422A03RikA2BHN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4931422A03RikA2BHN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931422A03RikA2BHN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931422A03RikA2BHN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms