Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402F06RikA2AUQ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402F06RikA2AUQ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930402F06RikA2AUQ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930402F06RikA2AUQ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402F06RikA2AUQ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930402F06RikA2AUQ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930402F06RikA2AUQ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930402F06RikA2AUQ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms