Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn34c4A2ANA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c4A2ANA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c4A2ANA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34c4A2ANA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34c4A2ANA3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34c4A2ANA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34c4A2ANA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms