Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd4A2AKM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd4A2AKM2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Hacd4A2AKM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd4A2AKM2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd4A2AKM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd4A2AKM2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hacd4A2AKM2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd4A2AKM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd4A2AKM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms