Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kiaa1109A2AAE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kiaa1109A2AAE1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kiaa1109A2AAE1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kiaa1109A2AAE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1109A2AAE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1109A2AAE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1109A2AAE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1109A2AAE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms