Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Calcoco2A2A6M5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calcoco2A2A6M5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calcoco2A2A6M5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calcoco2A2A6M5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calcoco2A2A6M5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Calcoco2A2A6M5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calcoco2A2A6M5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calcoco2A2A6M5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms