Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2l1A2A259 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2l1A2A259 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l1A2A259 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l1A2A259 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l1A2A259 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2l1A2A259 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l1A2A259 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkd2l1A2A259 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms