Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms