Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
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