Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv2A0A0B4J1G8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trbv2A0A0B4J1G8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv2A0A0B4J1G8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv2A0A0B4J1G8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv2A0A0B4J1G8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trbv2A0A0B4J1G8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbv2A0A0B4J1G8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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