Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighv1-42A0A0A6YY38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv1-42A0A0A6YY38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighv1-42A0A0A6YY38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-42A0A0A6YY38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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