Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trbv21A0A0A6YX06 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trbv21A0A0A6YX06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trbv21A0A0A6YX06 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Trbv21A0A0A6YX06 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trbv21A0A0A6YX06 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trbv21A0A0A6YX06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv21A0A0A6YX06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbv21A0A0A6YX06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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