Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms