Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rlbp1Q9Z275 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rlbp1Q9Z275 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms