Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms