Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Clic4Q9QYB1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Clic4Q9QYB1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Clic4Q9QYB1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic4Q9QYB1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms