Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip3Q9QXT8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip3Q9QXT8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms