Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb1Q9QXJ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apbb1Q9QXJ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb1Q9QXJ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms