Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms