Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD163L1Q9NR16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD163L1Q9NR16 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms