Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tulp4Q9JIL5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tulp4Q9JIL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp4Q9JIL5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms