Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms