Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BCAS3Q9H6U6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms