Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc89Q9DA73 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms