Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms