Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capns2Q9D7J7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capns2Q9D7J7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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