Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms