Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem50aQ9CXL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem50aQ9CXL1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms