Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RpainQ9CWY9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RpainQ9CWY9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms