Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MINDY3Q9CV28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms