Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnpda2Q9CRC9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms