Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029F12RikQ9CRB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms