Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nicn1Q9CQM0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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