Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms