Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms