Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms