Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DhddsQ99KU1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DhddsQ99KU1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms